按主板的结构特点分类还可分为基于CPU的主板、基于适配电路的主板、一体化主板等类型。基于CPU的一体化的主板是较佳的选择。
按印制电路板的工艺分类又可分为双层结构板、四层结构板、六层结构板等；以四层结构板的产品为主。
按系统总线的带宽分类，如66MHz主板、100MHz主板等。
按数据端口分类，如SCSI主板、EDO主板、AGP主板等。
按扩展槽分类，如EISA主板、PCI主板、USB主板等。
按生产厂家分类，如华硕主板、技嘉主板等。
无跳线主板这是一种新型的主板，是对PnP主板的进一步改进。在这种主板上，连CPU的类型、工作电压等都无须用跳线开关，均自动识别，只需用软件略作调整即可。经过Remark的CPU在这种主板上将无所遁形。
486以前的主板一般没有上述功能，586以上的主板均配有PnP和节能功能，部分原装品牌机中还可通过主板控制主机电源的通断，进一步做到智能开/关机，这在兼容机主板上还很少见，但肯定是将来的一个发展方向。无跳线主板将是主板发展的另一个方向。