新疆阿勒泰地区拥有新疆第一大天然林。其中，阿尔泰山林区是新疆最大成片的原始森林，森林面积占全疆森林的一半，素有北疆“水塔”之称。这里还有我国唯一一条流入北冰洋的河流——额尔齐斯河。优越的生态系统被国务院确定为水源涵养型山地草原生态功能区，被称为新疆“生态北屏障”。